发现了自来也，小南问长门怎么办，长门回答：“既然他不会成为我们的同伴，那就杀掉他。”长门知道，自来也的想法和弥彦是一致的，当他选择了与弥彦相反的道路时，他和自来也之间就只能是敌人。或许长门已经有意避开他，将木叶的九尾列为最后捕捉的目标，但现在自来也找上门来，他决定就此了断。

    小南依靠式纸之舞的机动性先行找到了自来也，但与其说她是来杀他的，更像是给他的最后警告。自来也问她：“佩恩到底是谁？”小南回答：“跟老师没关系。”

    初交手，自来也用火遁烧尽了小南的纸雨，并用蛤蟆油弹黏住了她，小南的纸沾上油后无法分散，被自来也的乱狮子发之术抓住。此时只要他点燃蛤蟆油炎弹，恐怕小南就再见了，但自来也不忍对这个曾经的徒弟下手。小南问他：“事到如今，你为什么要出现在我们面前？”自来也回答：“并没有什么打算，如果你们不是晓的话。毫无疑问你们是我的弟子，但晓的所作所为是错误的。”

    长门：“那是我们通过自己得出的答案，自来也老师！”长门控制的佩恩赶到了。他让小南退下，他知道小南没有能力也没有意愿杀害老师，他不想强迫小南，弑师的罪孽就由他一人来承担吧。

    之后佩恩和自来也的激战中，小南一直没有插手，这是长门与弥彦的道路最后的诀别，家人间的战斗，她选择两不相帮。当然了，小南本可以阻止他们，如果她有足够的力量，但与长门和自来也相比，她太弱小了，只能成为旁观者。

    自来也与长门的战斗，双方都没有留情，在用幻术蛤蟆临唱控制了佩恩三道后，自来也毫不犹豫的干掉了他们，他以为长门就在其中；而佩恩六道偷袭得手，抓住机会后，也立刻杀死了自来也。这是两种意志的针锋相对，没有回旋的余地。自来也死后，长门和小南对木叶村再无任何顾忌，正好此时鼬和带土的协议也终止，于是他们一鼓作气，直接进攻木叶，但他们不知道，九尾人柱力鸣人此时不在木叶村。这场战争中，小南一直在打探九尾的情报，但一无所获，鸣人此时正在妙木山修行仙术，这是最高机密。

    后来油女志乃父子及其族人出现在小南面前，油女一族是木叶低调且强大的秘术家族，他们用查克拉饲养的寄坏虫可以啃食小南的式纸之舞，算是比较克制。但小南使出纸分身，并在其中夹杂了起爆符，瞬间消灭了大量虫子，油女一族的人如临大敌。

    这时佩恩已经从纲手的助手静音身上获得了情报：“鸣人在妙木山”。于是小南撤退了，他们没有必要在这里浪费时间。但临走前，佩恩给木叶留下了一份“大礼”。

    不知是长门心存对木叶忍者杀死他父母的仇恨，还是只是想让木叶感受一下雨隐村长期遭受的痛苦，他控制佩恩天道释放了一个超大型神罗天征。尽管这次小南试图阻止他，但长门却听不进去。神罗天征几乎将木叶夷为平地，只剩了一面火影岩。

    这时鸣人学成仙术归来，与佩恩进行了激烈的战斗，最后他击败了佩恩天道，并通过长门用来控制佩恩的黑棒，逆向找出了他们的藏身之处。这是小南用神之纸者之术伪装的一棵大树，鸣人终于见到了长门，这个杀死自来也师傅、卡卡西老师，摧毁木叶村的罪魁祸首，同时也是自己的师兄。


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