既然皇上已经驾崩，北京的朝廷已经被连锅端掉了，那么，摆在南京朝廷面前的首要任务便是确立新君以重建帝国。那么，到底立哪位藩王做这大明朝的新皇帝，朝臣们是公说公有理婆说婆有理。以血统亲近论来看，福王朱由崧、惠王朱常润、桂王朱常瀛、璐王朱常淓都是可选的。按照轮序观念，最先考虑的自然是福王，因为四王之中，只有福王是崇祯帝的弟弟，跟崇祯帝是一辈儿，符合我们传统理念上的“兄终弟及”的观念。大部分实力派官员主张迎立福王，作为首席大臣的史可法内心也认为按照伦序自然也是要迎立福王的。这看似本该毫无争议的立新君的大事，却因为钱谦益而全盘被打乱了。

    这钱谦益是江苏常熟人，当时是朝中清流派中东林党的领袖，他坚决反对立福王为嗣，以“立贤”为名到处游说，提议迎立璐王。朝中有不少人支持他，好端端的拥立之事一下在变得扑朔迷离起来。史可法既不愿意得罪拥戴福王的实力派，又不愿与拥立潞王的东林党撕破脸，于是想出了一条自以为是的妙计，还跑到浦口跟凤阳总督马士英商量：立桂王，福王、璐王都不要了。

    如果两人达成的协议能够奏效的话，大不了就是桂王做了新君，二人同有拥戴之功罢了，可是，偏偏事情就那么不凑巧。守备凤阳太监，名唤卢九德一心拥立自己的老主子福王，想贪这天下第一功。他与朱由崧密谈，表示可以借用高杰、黄得功、刘良佐三个藩镇的力量，逼迫朝廷就范，继续立朱由崧为新君，放弃立桂王的想法。马士英听说自己手下的四大将军有三个都已经倒向福王，知道木已成舟，自己再坚持立桂王，不但无济于事，还会落得个前程全无，还不如早点倒向福王，落一个拥戴之功。山东总兵刘泽清听说高、黄、刘、马倒向福王，知道自己的兵力不及对方，做出了个识时务者为俊杰的打算，随风转舵，支持福王继承大统。到这时候，福王继位已成定局。

    面对福王继位，东林党即便再不愿意，也毫无办法，战乱年间，手里有枪远比口里有枪强得多。史可法对此也毫无办法，只得亲自去淮安接朱由崧到南京继位。

    五月初一，在史可法陪同下，朱由崧登陆南京，初三就任监国，任命史可法为东阁大学士兼礼部尚书，入内阁，以马士英为东阁大学士兼兵部尚书、入内阁。这时候的史可法，虽然表面上仍然是南京朝臣之中的第一大臣，其实早已经失掉了朱由崧的信任。因为马士英在定策问题上偏向朱由崧，而史可法却是主张立桂王。朱由崧嘴上不说，心里却跟明镜儿似的，经常约马士英入宫商议国家大事，却从来不叫史可法入宫。史可法心里知道，这是朱由崧在冷淡自己，朝内的前途清楚明白得很。既然得不到朱由崧的器重，还不如离开京城，到外面去掌握一支武装，以防备非常之事，于是，他向朱由崧请求，希望朝廷准许自己督师扬州，统率江北各部队，以保卫长江天险，确保南京无虞。朱由崧答应了史可法的请求，他巴不得这个多嘴多舌的尚书早点走掉，自己好做些自己的事情。但是，他没有批准史可法立刻离开。

    五月十二，朱由崧亲自派人召史可法入宫。

    见史可法走进门内，朱由崧迎上前去，笑着问道：“史公为朝廷重臣，日后我还要多多倚仗你帮我做些朝
    （本章未完，请翻页）