领土分封给他的3个儿子及其弟统辖。其长子麦利克，艾弗达勒以大马士革为中心，领有叙利亚南部地区；次子阿齐兹以开罗为中心，领有埃及；三子扎希尔以阿勒颇为中心，领有叙利亚北部地区；萨拉丁之弟阿迪勒领有卡拉克和邵伯克。1193年萨拉丁去世后，诸子争位，互相倾轧，阿尤布王朝陷于分裂。1196～1199年间，萨拉丁之弟阿迪勒利用这种混乱局面，夺取了埃及、叙利亚大部和美索不达米亚的统治权，自立为素丹。最终由阿迪勒一世于1200年登上苏丹的宝座。1218年阿迪勒去世后，王朝进一步瓦解，阿迪勒的后裔卡米勒等分别统治埃及、大马士革和美索不达米亚；萨拉丁的后裔支系则控制霍姆斯、也门和哈马。法兰克人利用王朝的分裂和内乱，重又夺回贝鲁特、萨费德、太巴列、阿什克伦等城市。此时，十字军在埃及本土登陆。1229年，埃及阿尤布王朝统治者卡米勒(1218～1238在位)与十字军缔结和约，将耶路撒冷及阿卡走廊割让给十字军。12年，卡米勒的第二继任者麦利克，萨利赫·奈季姆丁(122～129在位)借助中亚花刺子模突厥人的力量，收复了耶路撒冷。

    129年11月，萨利赫逝世，其宠妾谢杰莱·杜尔秘不发丧。3个月后，萨利赫前妻之子穆阿扎姆·突兰沙从美索不达米亚率军返回开罗后继其父位。突兰沙的军队俘虏法王路易九世，将十字军赶出埃及。1250年，王朝的马穆鲁克卫队首领艾伊贝克与谢杰莱·杜尔合谋，将突兰沙杀害，马穆鲁克首领掌握军政大权，从此阿尤布王朝名存实亡，后被马穆鲁克王朝所取代。但自从1250年代起，尤其是蒙古人在1260年取得对阿尤布王朝的控制之后，王朝愈加衰微。蒙古人离开以后，马木留克（马穆鲁克）人在哈马推翻了阿尤布王朝最后一任统治者。尽管时间短暂，但是阿尤布王朝开创了一个经济繁荣的时期，并且使得伊斯兰世界的文明再一次兴盛。阿尤布王朝的HinKayfa公国仍统治着东南部安纳托利亚，133年，阿尔图格王朝作为伊儿汗国的附庸对HinKayfa进行了一场不甚成功的战争，但最终迫使阿尤布王朝割让了底格里斯河左岸。1世纪，阿尤布王朝重建了HinKayfa城作为据点，16世纪早期被土耳其奥斯曼帝国吞并。

    在宗教上，以伊斯兰教逊尼派教义为国教，素丹均自称为伊斯兰教的捍卫者，尊崇阿拔斯王朝哈里发的宗教领袖地位，修葺和保护圣地麦加、麦地那和耶路撒冷的宗教建筑，由国库拨付巨额宗教基金，资助圣地的宗教活动。为弘扬逊尼派教义和学说，萨拉丁曾下令在各地清真寺派逊尼派长老主持教务，在爱资哈尔大学及其他宗教学校传授逊尼派教义和四大法学派的学说。在全国各地建立济贫院、里巴特(扎维亚)等，接待游方的苏菲派苦行者，供苏菲派传教师讲经布道，培养门徒，并给各道堂赐予瓦克夫土地。对埃及和叙利亚的基督教徒采取宽容政策，允许其修建教堂和进行正常宗教活动。在开罗、大马士革、希贾兹、也门等地创建独立的或由清真寺附设的伊斯兰大学，免费提供食宿，仅大马士革就有高等学校20所，以开罗的沙斐希叶学校最为有名。爱资哈尔大学得到扩建和发展，成为逊尼派的教育学术中心。阿尤布王朝捍卫了古埃及的文明和伊斯兰文化。

    阿尤布王朝素丹是行政和军事的最高领
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